Ich hatte eher die Befürchtung, dass sich der Reader über den seriellen Port Strom zieht,
Deshalb schrieb ich ja, es kommt darauf an, was dran hängt.
Normalerweise haben die RS-232 Leitungen im Ruhezustand negatives Potential, und deshalb sollte sich der Reader nicht daraus versorgen können, aber sicherheitshalber solltest das ausprobieren, ob dir nicht vielleicht eine Software z.B. mittels "Send Break" einen Strich durch die Rechnung macht.
Außerdem solltest du prüfen, ob dein RS-232 Treiber abschaltbar ist, denn die Stromersparnis relativiert sich sofort, wenn der Treiberchip dauernd positiven oder negativen Strom in irgendwelche Schutzdioden schickt.
wenn GND oder +5V getrennt wird
GND abzuschalten ist zwar auch möglich, aber man sollte wegen der möglichen Probleme wie Nichtabschaltung durch Masseschleifen und negative Eingangsspannungen an den Chips davon keinen Gebrauch machen.
Ich habe gelesen, dass die Schutzdioden des µC ausreichend sind, wenn die Verbindung nicht trennbar ist?!
Wenn der MOSFET bis dahin überlebt ...